Да, возможно с помощью хака, если другое AIR приложение поддерживает Browser Invocation (за это отвечает <allowBrowserInvocation>true</allowBrowserInvocation> в дескрипторе приложения). Прочитать как это сделать можно здесь:
http://www.davidtucker.net/2008/04/0...r-application/