[mooncar]

Если импортировать AI во флеш - есть два режима, флеш должен спросить - как вектор или как растр (менюшка в начале импорта появляется).
Кстати - о каких слоях вы говорите - там нет слоев, если в векторе импорт делать.
Просто сгруппированные векторные шейпы и все. Можете их аккуратно разбить обычным Ctrl + B.