[DenisS1]

var matrix:Array=[];
 
for(var i=0;i<n;i++){
   matrix[i]=[];
   for(var j=0;j<n;j++){
      matrix[i][j]=0;
   }
}

Вот мы получили проинициализрованную нулями матрицу n*n. В чём проблемы?