Странно - у вас MCL грузит swf-ки в контейнеры с названиями 1 и 2? Или это вы типа уровни та задаете. Синтаксис другой:

Код:
loadClip (MovieClipLoader.loadClip method)
public loadClip(url:String, target:Object) : Boolean
Вторым аргументом задается мувик-контейнер, куда грузите. Создайте пустой клип и туда грузите.
Еще есть подозрение, что у вас ролик new что-то начинает делать, не дождавшись полной загрузки swf-ок (например, переходит на второй кадр или пытается как-то управлять загруженным контентом).
Класс MCL сам практически является прелоадерем, его для этого и придумали.
У него есть обработчики событий, например onLoadInit. Только по этому событию и нужно, если что, выполнять какие-то дальнейшие действия в основном ролике или загруженных.
Покажите побольше кода.