Когда создаете экземпляры мувиклипа, ложите их ссылки в массив:

Код AS3:
arrayMc.push(myMc);
а когда удаляете, удаляйте их слушатели и их самих через массив:

Код AS3:
for (var i:int = 0; i < arrayMc.length; i ++) {
arrayMc[i].removeEventListener(MouseEvent.CLICK, onClickMc);
arrayMc[i].removeEventListener('myListener', onMyListener);
removeChild(arrayMc[i]);
arrayMc[i] = null;
}
arrayMc = [];