[mooncar]

Для начала при публикации флешки на странице используйте SWFObject. Эта технология позволяет небраузерным запросам отдавать вместо swf-ролика альтернативный текстовый конетент.
А потом вам нужно уже дальше думать - как быть с флешевсими кнопками-ссылками и документами, которые по ним лежат.
Например, конетент из-под них тоже перевести в текстовый вид и разместить на главной, в том же альтернативном текстовом блоке.
Но вообще, конечно, флеш был выбран зря, у вас там все можно было на HTML написать, никаких причин делать в вашем случая все на флеше я не вижу.
Аниимировать заставку, топ, кнопки и все..