pause - это метод класса NetStream, используется для управления потоковым видео.
Внедренное же видео проигрывается по мере движения головки по таймлайну, по которому видео растянуто.
Нужно остановить сам таймлайн:

Код AS1/AS2:
stop();
Либо заключите таймлайн с внедеренным видео в мувик, например, video_mc,
тогда будет работать

Код AS1/AS2:
video_mc.stop();
...
video_mc.play();