Оно не "пролазит", а остается от неинициализированного массива. Вы i, видимо, увеличиваете в цикле, и элементы массива нумеруете той же переменной. Введите хотя бы переменную j, которая в начале будет равна нулю и увеличиваться на единицу при каждом присвоении.
Код:
var j = 0;
....// тут видимо начало цикла
lik2 = _root.menu_xml.firstChild.childNodes[i].childNodes[1].childNodes[0];
if(lik2 != undefined){
activs[j] = lik2;
j++;
}