Я думаю, что даже apt-get install eclipse должно работать

Суть то она в том, что для эклипса написано очень много плагинов. Я использую EclipsePHP, Erlide, hxclipse, какие-то плагины для работы с JavaScript и XML (не помню как называются), ну и плюс к этому Subclipse (не использую и не буду, но есть) и AXDT - тоже плагин для AS3, но очень простой и с плохой поддержкой, но вроде все еще живой (тоже не использую, но есть), помимо билдера. Эклипс это как бы сугубо персональная вещь - поставили основу и довешиваете к ней чего нужно.