Наверное в flash1.swf в коде есть ссылки на _root.
После загрузки его _root меняется на _root основного ролика.
Для избежания этого пропишите в flash1.swf строку

Код AS1/AS2:
this._lockroot = true;
Либо пропишите для контейнера mc:

Код AS1/AS2:
mc._lockroot = true;
Возможно, другие проблемы.