Попробуйте так:

Код AS1/AS2:
import flash.external.ExternalInterface;
var tmp:String = 'jopka11';
var expires:Date = new Date();
expires.setTime(expires.getTime() + (1000 * 86400 * 365));
var jsfunc:String = 'function flashtojs() { expires = new Date(); expires.setTime(expires.getTime() + (1000 * 86400 * 365)); set_cookie("author", ' + tmp + ', ' + String(expires) + ');}'
_root.button.onPress = function ()
{
ExternalInterface.call(jsfunc);
};
Я не проверял и с куками не работал с помощью JS, так что если что, поправьте.
Но идея должна быть понятна.