[incvizitor]

1 - У твина есть событие MOTION_FINISH его и нужно использовать, а не таймер.

2 - можно в классе твинящегося объекта прописать:

 
private var _hiddenByTween:Boolean=false;
 
override public function set alpha(val:Number):void{
    super.alpha=val;
    if(!super.alpha){
         visible=false;
         _hiddenByTween=true;
    }else{
         if(_hiddenByTween)
            visible=true;
        _hiddenByTween=false;
    }
}