[Idon]

Psycho Tiger, и mail.ru, и facebook и одноклассники рабтают c flash приложениями через iframe + flash api.
Таким образом, достаточно выложить у себя на сервере новую версию флэшки и всё. Но для того, чтобы работать с flash api вконтакте, надо отдельно аплоадить туда флэшку. насколько я понял

Добавлено через 2 минуты
Astraport, конкретно для этого там flash-контейнер используется. по-сути, тот же iframe, но c обязательным upload'ом swf.