ты перекидываешь просто сами каналы , при этом не останавливается воспроизведение (скорее всего обычная задержка) , проще иметь 2 Sound'а и из первого пихать в второй на том моменте где остановилось воспроизводство :
Код AS3:
musicPosition = Sound1.SoundChanel.position;
Sound2.play(musicPosition);