В Air-приложениях параметры есть, даже drag&drop можно подключить (открытие файлов перетаскиванием в прогу из файл-менеджера)
В чистом флеш, насколько знаю, такого нет.
Брешу

Код:
flashplayer FlashVarsViewer.swf?parameter=parameterValue
параметр попадет во flashVars
Примечание:
естественно, нужно добавить путь к flashplayer'у в переменную среды PATH, или указать полный путь до флешплеера