поставь индекс слою.
Добавлено через 9 минут
или используй
Код AS3:
viewport.interactive = true;
...
...
...
cubeMaterial.interactive = true;
...
...
d3doCube.addEventListenet(InteractiveScene3DEvent.OBJECT_CLICK, cubeClick);
...
private function cubeClick(e:InteractiveScene3DEvent):void{
//e.DisplayObject3D - сам куб
//e.Face3D - треугольник над которым находится мышка
...
}