Поместите на фон загружаемой флешки шейп или прозрачный спрайт тогда размеры флешки и содержимого будут совпадать. или как вариант прибавляйте к intro.width и intro.height расстояние до самого верхнего левого элемента. или пользуйтесь intro.scaleX/intro.scaleY если вам известны размеры загружаемой флешки
Код AS3:
var h:Number = 300;
var w:Number = 500;
//размер загружаемой флешки
var hr:Number = logo.height;
var wr:Number = logo.width;
//нужно изменить размер до размера logo
intro.scaleY = hr / h;
intro.scaleX = wr / w;