Можно помещать код в блоки вида

Код AS3:
CONFIG::debug {
trace("Debug mode detected");
}
CONFIG::release {
// мы в релизе, ничего не делаем
}
При таком раскладе, если вы собираете проект под релиз, часть кода для дебага вообще не появится в результирующем swf-файле (правда про работоспособность такого метода в Flash IDE я ничего сказать не могу)