Лучше не пользуйтесь width / height... самый оптимальный вариант, если нужно вручную что-то анимировать - используйте transform.matrix - туда шаловливые рученки разработчиков фреймворка не добрались, и оно работает нормально
С другой стороны, есть уже готовые эффекты написаные для флексовых компонентов. Откровенно говоря, я ими практически не пользовался, но как-то первый раз попробовав сразу натолкнулся на какой-то глюк...
Да или пробуйте вместо width / height measuredWidth / measuredHeight или explicitWidth / explicitHeight и т.д.
А, ну да, и еще валидация размеров флексовых компонентов тоже происходит в ентерФрейме, так что возможен еще и такой вариант, что ваши изменения перекрываются следующей за ними валидацией.