[Wolsh]

Массивы (да и обычные переменные тоже) хранят ссылки на объекты, а не копии объектов. То есть в нулевой ячейке массива mainMass хранится ссылка на массив mass, или его адрес. Что бы ни происходило с массивом mass, всегда будет происходить и с mainMass[0] — это просто один и тот же объект, на который есть две разные ссылки. Если Вы хотите хранить РАЗНЫЕ объекты, то Вам нужно СОЗДАТЬ эти разные объекты. Например, mainMass[0] = mass.concat();