[fresh.flash]

Это если мувики в руте и называются mc1, mc2 и т.д. В результате будет 100 массивов для каждого мувика

for (var i:Number=0; i < 100; i++) {
	_root["peresechenieArray_"+i] = new Array();
	for (var j:Number=0; j < 100; j++) {
		if (i != j) {
			if (_root["mc"+i].hitTest(_root["mc"+j]) {
				_root["peresechenieArray_"+i].push(_root["mc"+j]);
			}
		}
	}
}