FD автоматически добавляет папку Bin в разрешенные безопасностью папки, то есть, создает файлик cfg. В семерке он находится по этому адресу: C:\Users\Юзверь\AppData\Roaming\Macromedia\Flash Player\#Security\FlashPlayerTrust. У меня вот такой: FlashDevelop.cfg с содержимым вот таким:
Код:
D:\РАБОТА\FD\бла-бла\bin
D:\РАБОТА\FD\бла-бла-бла\bin
D:\РАБОТА\FD\бла-бла-бла-бла\bin
Вам нужно там указать D:\ или C:\ или все вместе.