[antonyrec]

Eсли надстройки не хочешь использовать, то можно так:
1) средсвами флеша кладем в буфер, например, "run.exe qwe.pdf"
2) запускаем программу (придется самому написать), которая вытаскивает из буфера текст "run.exe qwe.pdf" и запускает приложение "run.exe" с параметром "qwe.pdf"