На счет обфускатора
http://active.tutsplus.com/tutorials...as3obfuscator/
На счет самых используемых в играх классах: MovieClip, Sprite, Bitmap, BitmapData, Array, Object, EventDispatcher.
Думаю никто не станет спорить с тем, что эти классы очень часто используются при написании игр