Ну в самом FlashPaper нельзя , а когда подгружаешь можно убрать , жмём Ctrl+Shift+Enter и смотрим из чего слеплен наш подгруженный файл, и делаем соответствующие изменения ... ну например
убираем toolBar >>

Код:
_root.createEmptyMovieClip("mc", 1);
mc.loadMovie('a.swf');
onMouseDown = function () {
mc.toolbar_mc._visible = false;
};
кликни мышкой по полю и всё увидишь ... a.swf - это слепленый в пайпере файл ... правда первый раз придётся помучаться, за то потом будешь знать наверняка что надо отключать ...
