Есть вероятность, что были использованы идентификаторы, которые в эмыксе стали осмысленными (predefined), вроде onMouseDown или еще чего-то. Кроме того, если при программировании пришлось залазить в объектную модель пятерки, то у шестерки она другая. Скажем конструкция
Код:
function Fun() {
Bla("Bla");
}
SomeClip.callBack = Bla;
при вызове из мувика SomeClip будет абсолютно по разному адресовать в пятерке и эмыксе соответственно. Есть и другие тонкости. Лучше всего переписать код.