[rtm]

1. .htaccess читается Web-сервером Apache, с помощью этого файла можно очень много всего сделать, например, аутентификацию, переопределение индексного файла для директории и т.д., и т.п.
2. Пустой .htaccess - не страшно.
3. ХЗ - может у хостера спросить.
4. Я - не юзал.