Во флэш приложении, имеется в виду флэш-проектор, ничего кроме функции fscommand нет для запуска других приложений. Ее область применения довольно ограничена. Потому и придумывают разные "EXE-builder"-ы. Просто открыть папку можно так:

Код:
getURL("file:///f:\\my_folder");
Только вот откроется папка в окне веб-браузера...