Дефолтные команды в FlashDevelop.

[iNils]

1. Ctrl+Shift+1
2-3. См. клавиши в пункте меню Refactor (хотя на текущий момент, клавиши могут тупить до первого ручного вызова через меню. Это в 3.3.4, который еще в феврале вышел. Ждем выхода 4-ки). Клавиши можно менять в настройках FD, плагин CodeRefactor
4. Ctrl+Space
5. Да. В FD входит плагин FlashDebugger. Но я не пользуюсь дебагерами, поэтому подробно рассказать не могу.
6. В контекстом меню File All References. Шоткей у меня Ctrl+F4, но вроде я его менял под себя.