Flash SC3, как и Flex2 - всего лишь промежуточные версии перед более грамотными продуктами. Такие "полуфабрикаты" выпускают многие, взять например Windows Me или Vista у Microsoft.
Так что я думаю в IDE еще мноооооого таких вот сюрпризов.
Удачных находок!