по клику запоминаем координаты, moveTo/lineTo в эти координаты, если близко к первой точке (<tol) заливаем..

Код:
lineStyle(0);
var tol=20;
var path=[];
function onMouseUp(){
path.push({x:_xmouse,y:_ymouse});
if(!started){
moveTo(_xmouse,_ymouse);
started=true;
}else{
lineTo(_xmouse,_ymouse);
var dx=_xmouse-path[0].x,dy=_ymouse-path[0].y;
if(Math.sqrt(dx*dx+dy*dy)<tol){
clear();
moveTo(path[path.length-1].x,path[path.length-1].y);
beginFill(0xFF0000);
lineStyle(0,0x00FF00);
for(var i=0;i<path.length;i++)lineTo(path[i].x,path[i].y);
endFill();
}
}
}