Получить аналог QuickBuild из FD. Проблема в том, что если у вас проект MXML, то вы не можете в FB скомпилировать AS файл... Логики в этом никакой, но жить с этим не возможно
UPDATE:
Вот, чем в итоге все закончилось, в смысле - получилось

Код:
#!/bin/bash
AS=`echo $2`
SWF=${AS%.*}
echo `~/flex/off-sdk-4/bin/mxmlc $1/$2 -o $3/bin/$SWF.swf -sp $3/src -static-link-runtime-shared-libraries=true -debug=true`
java -Xmx384m -Dsun.io.useCanonCaches=false -Dapplication.home=~/flex/off-sdk-4 -jar ~/flex/off-sdk-4/lib/fdb.jar "$3/bin/$SWF.swf"
Вот, собственно, теперь я могу скомпилировать произвольный файл + сразу же запустить дебаггер + получить аутпут из дебаггера обратно в эклипс + контролировать выполнение (брейкпоинты, посмотреть текущую строку, пошагово выполнить код и т.д.).